[BMIM][NTf2]的結(jié)構(gòu)如下
乙醇在[BMIM][NTf2]中的常溫下的溶解自由能實(shí)驗(yàn)值為-3.76 kcal/mol(來自那篇JPCB文章補(bǔ)充材料Table S1.6,對(duì)應(yīng)氣相和溶劑下都是1M標(biāo)準(zhǔn)態(tài)濃度)。我們看看利用SMD-GIL的參數(shù)算出來的結(jié)果是多少。如《談?wù)勲[式溶劑模型下溶解自由能和體系自由能的計(jì)算》所述,我們先對(duì)結(jié)構(gòu)優(yōu)化,然后用M052X/6-31G*在溶劑模型下和氣相下分別算個(gè)單點(diǎn),求差就是常溫下的溶解自由能(對(duì)應(yīng)氣相和溶劑下都是1M標(biāo)準(zhǔn)態(tài)濃度)。
SMD幾乎是目前最流行的隱式溶劑模型,因此很多主流程序都已經(jīng)支持SMD,比如Gaussian、NWChem、ORCA、GAMESS-US等(而非主流的Dmol3和ADF之流尚不支持)。這里我們用量化計(jì)算最常用的Gaussian作為例子,結(jié)構(gòu)已經(jīng)在B3LYP/TZVP下優(yōu)化過(用什么級(jí)別優(yōu)化無所謂,只要是合理級(jí)別即可,對(duì)溶解自由能計(jì)算結(jié)果影響很?。?/p>
單點(diǎn)任務(wù)的輸入文件如下:
# M052X/6-31G*
B3LYP/TZVP opted
0 1
C 1.17643900 -0.39950500 0.00000000
H 1.15236000 -1.03828400 0.88463100
H 2.11738900 0.15557800 0.00000000
H 1.15236000 -1.03828400 -0.88463100
C 0.00000000 0.55417200 0.00000000
H 0.04041900 1.20079700 -0.88644000
H 0.04041900 1.20079700 0.88644000
O -1.20073500 -0.22291400 0.00000000
H -1.95570500 0.37470800 0.00000000
溶劑模型下的單點(diǎn)任務(wù)的輸入文件如下。這里我們自己完全自定義了一個(gè)新溶劑,除了芳香度和鹵素度以外的溶劑參數(shù)就是上面提到的SMD-GIL的平均離子液體溶劑參數(shù)。
# M052X/6-31G* SCRF(SMD,read,solvent=generic)
B3LYP/TZVP opted
0 1
C 1.17643900 -0.39950500 0.00000000
H 1.15236000 -1.03828400 0.88463100
H 2.11738900 0.15557800 0.00000000
H 1.15236000 -1.03828400 -0.88463100
C 0.00000000 0.55417200 0.00000000
H 0.04041900 1.20079700 -0.88644000
H 0.04041900 1.20079700 0.88644000
O -1.20073500 -0.22291400 0.00000000
H -1.95570500 0.37470800 0.00000000
eps=11.5
epsinf=2.0449
HBondAcidity=0.229
HBondBasicity=0.265
SurfaceTensionAtInterface=61.24
CarbonAromaticity=0.12
ElectronegativeHalogenicity=0.24
上面文件中設(shè)的CarbonAromaticity就是芳香度,ElectronegativeHalogenicity是鹵素度。[BMIM][NTf2]的化學(xué)組成為C10H15F6N3O4S2,重原子數(shù)(非氫原子數(shù))為25,此體系中咪唑環(huán)上的碳屬于芳香碳,數(shù)目為3,因此芳香度為3/25=0.12。體系中鹵素有6個(gè),因此6/25=0.24就是鹵素度。
對(duì)兩個(gè)文件用Gaussian16 A.03版進(jìn)行計(jì)算,氣相單點(diǎn)能為-154.9998251,溶劑下單點(diǎn)能為-155.0061949,因此溶解自由能為627.51*(-155.0061949+154.9998251)=-3.997 kcal/mol,和實(shí)驗(yàn)值-3.76 kcal/mol相符不錯(cuò)。
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